摘 要：本文对基本群优化方法进行了改进，提出一种异步消减群优化方法，从生物意义、碱基对、序列和二级结构四个层次对LncRNA进行特征提取，采用异步消减群优化方法进行了相似度计算，进而提出一种新型与疾病关联的LncRNA预测方法。实验结果表明，该方法预测准确率较高，具有很高的推广应用价值。
关键词：异步消减；群优化；疾病关联；LncRNA；预测
作者介绍：
王波（1980-），男，博士研究生，副教授。研究方向：生物信息学；通讯作者：张菁（1965-），女，博士后，教授，博士生导师。研究方向：计算分子生物学、虚拟现实、医学图像处理。
中图分类号：TP311 文献标识码：A 文章编号：2096-4706（2018）01-0000-03
LncRNA PredictionMethod for Disease Association Based on Asynchronous Subtractive Group Optimization
WANG Bo1，2，ZHANG Jing1
（1.Collegeof Computer Science and Technology，Harbin EngineeringUniversity，Harbin 150001，China；2.Modern Education Technology Center，QiqiharUniversity，Heilongjiang Qiqihar 161006，China）
Keywords：asynchronoussubtractive ；group optimization；disease associations；LncRNA；prediction
参考文献：
[1] Xiong，Yongfu；Wang，Rong；Peng，Linglong. An integrated lncRNA，microRNA and mRNA signature to improve prognosisprediction of colorectal cancer [J].ONCOTARGET，2017，8（49）：85463-85478.
[3] Hu，Huan；Zhu，Chunyu；Ai，Haixin. LPI-ETSLP：lncRNA-protein interaction prediction using eigenvalue transformation-basedsemi-supervised link prediction [J].MOLECULAR BIOSYSTEMS，2017，13（9）：1781-1787.
[5] Zhou，Meng；Zhang，Zhaoyue；Zhao，Hengqiang.A novel lncRNA-focus expression signature for survival predictionin endometrial carcinoma [J].BMC CANCER，2018，18：39.
[7] Ning S，ZhangJ，Wang P，Zhi H，Wang J，Liu Y，Gao Y，Guo M，Yue M，Wang L andLi X. Lnc2Cancer：a manually curated database of experimentallysupported lncRNAs associated with various human cancers. Nucleic Acids Research.2016，44：D980-D985.
<p CxSpMiddle" style="text-indent:21.0pt">[8] Zhou M，WangX，Li J，Hao D，Wang Z，Shi H，Han L，Zhou H and Sun J. Prioritizing candidate disease-related long non-codingRNAs by walking on the heterogeneous lncRNA and disease network. Molecular Biosystems.2015，11：760-769.